Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms