Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AMPD1P23109 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms