Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNB1P20700 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms