Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DPA1P20036 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms