Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRT4P19013 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRT4P19013 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms