Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARBP10826 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARBP10826 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARBP10826 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARBP10826 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms