Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CLDN20-201ENST00000367165 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CNIH1-202ENST00000395573 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC107302.1-201ENST00000467059 1032 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AP005265.1-201ENST00000584914 872 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC104113.1-201ENST00000607723 479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 C18orf12-201ENST00000623329 537 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 C5orf60-208ENST00000625191 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL022476.1-201ENST00000443063 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TMSB15B-208ENST00000620307 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ATXN8OSP0DMR3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ATXN8OSP0DMR3 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC007036.3-201ENST00000511893 614 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 EIF1AD-207ENST00000529964 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 ZNF546-204ENST00000596894 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 SOX2-OT-244ENST00000627738 692 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATXN8OSP0DMR3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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