Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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PKHD1P08F94 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PKHD1P08F94 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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