Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOP08100 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOP08100 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHOP08100 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms