Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC4A1P02730 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms