Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA4FO95754 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA4FO95754 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA4FO95754 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA4FO95754 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms