Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GCATO75600 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCATO75600 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCATO75600 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms