Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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