Protein–RNA interactions for Protein: O15417

TNRC18, Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC18O15417 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TNRC18O15417 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TNRC18O15417 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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TNRC18O15417 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TNRC18O15417 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TNRC18O15417 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TNRC18O15417 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TNRC18O15417 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TNRC18O15417 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TNRC18O15417 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC18O15417 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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