Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBDO15205 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBDO15205 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBDO15205 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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