Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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