Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PATL2C9JE40 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms