Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms