Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VGLL3A8MV65 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VGLL3A8MV65 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms