Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KNCNA6PVL3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms