Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CFAP73A6NFT4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms