Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TARSL2A2RTX5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TARSL2A2RTX5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms