Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPDC1A2A3K4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms