Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E2F8A0AVK6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms