Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ARL2-SNX15V9GYD0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ARL2-SNX15V9GYD0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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