Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC1Q9Y5R8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms