Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TTF2Q9UNY4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms