Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLIP2Q9UDT6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms