Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DKK2Q9UBU2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms