Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX3Q9UBR4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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