Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DKK3Q9UBP4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms