Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC17A6Q9P2U8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms