Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
USP36Q9P275 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms