Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTLNQ9NXG0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms