Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMBRD1Q9NUN5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms