Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms