Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF407Q9C0G0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF407Q9C0G0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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ZNF407Q9C0G0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ZNF407Q9C0G0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ZNF407Q9C0G0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ZNF407Q9C0G0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF407Q9C0G0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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