Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHACTR1Q9C0D0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms