Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms