Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP2Q9BX26 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms