Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HIRIP3Q9BW71 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms