Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
VAMP8Q9BV40 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms