Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms