Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NDFIP1Q9BT67 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NDFIP1Q9BT67 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms