Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GORASP1Q9BQQ3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms