Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGME1Q9BQP7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGME1Q9BQP7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms