Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLF1Q9BQI6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms