Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms