Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNX1Q96RV3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms