Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf72Q96LT7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms